Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm20854Q62461 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms