Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AtmQ62388 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AtmQ62388 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms