Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Ss18Q62280 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18Q62280 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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