Protein–RNA interactions for Protein: Q62270

Srms, Tyrosine-protein kinase Srms, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmsQ62270 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrmsQ62270 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SrmsQ62270 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrmsQ62270 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SrmsQ62270 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrmsQ62270 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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