Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six3Q62233 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Six3Q62233 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Six3Q62233 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Six3Q62233 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Six3Q62233 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms