Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttf1Q62187 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ttf1Q62187 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttf1Q62187 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttf1Q62187 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttf1Q62187 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttf1Q62187 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms