Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sin3bQ62141 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sin3bQ62141 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms