Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prkd1Q62101 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms