Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms