Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f1Q61501 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2f1Q61501 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
E2f1Q61501 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms