Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd53Q61451 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms