Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2bQ61313 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms