Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms