Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd2Q61285 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms