Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc9a1Q61165 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc9a1Q61165 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms