Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trpc6Q61143 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trpc6Q61143 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms