Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Usf1Q61069 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Usf1Q61069 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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