Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift20Q61025 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift20Q61025 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms