Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JrkQ60976 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms