Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Laptm4aQ60961 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Laptm4aQ60961 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms