Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Neurod1Q60867 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Neurod1Q60867 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms