Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Caprin1Q60865 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Caprin1Q60865 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms