Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HellsQ60848 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HellsQ60848 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HellsQ60848 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms