Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfrsf8Q60846 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf8Q60846 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms