Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klf4Q60793 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klf4Q60793 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms