Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MarcoQ60754 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MarcoQ60754 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms