Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h2Q60644 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms