Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CttnQ60598 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CttnQ60598 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms