Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3aQ60520 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms