Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp13a3Q5XF89 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp13a3Q5XF89 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms