Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tnfsf15Q5UBV8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms