Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tsr1Q5SWD9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tsr1Q5SWD9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms