Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms