Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sco1Q5SUC9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sco1Q5SUC9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms