Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znrf3Q5SSZ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znrf3Q5SSZ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms