Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms