Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sun3Q5SS91 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sun3Q5SS91 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms