Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf215Q5SPX3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms