Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RilpQ5ND29 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms