Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms