Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp22Q5DU02 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp22Q5DU02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms