Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfmbt2Q5DTW2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms