Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf608Q56A10 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf608Q56A10 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms