Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eme2Q56A04 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eme2Q56A04 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eme2Q56A04 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eme2Q56A04 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eme2Q56A04 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eme2Q56A04 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms