Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc27a5Q4LDG0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms