Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syne3Q4FZC9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms