Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Carmil2Q3V3V9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms