Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pydc3Q3V3Q4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms