Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ccdc185Q3V118 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ccdc185Q3V118 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc185Q3V118 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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