Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrc43Q3V0L5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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